我科室随医院建制，现有各级各类医护人员20余名，其中主任医师、副主任医师、主治医师、住院医师共8名，开放床位42张，监护病房3张。是菏泽市第一批通过国家呼吸与危重症医学科规范化建设现场验收的单位，被评为国家二级医院优秀单位，也是中国肺癌防治联盟肺结节诊治基层分中心，华东地区介入呼吸病协作组成员单位，山东省呼吸区域医疗中心呼吸专科医联体单位，山东省心肺专科医联体单位，山东大学齐鲁医院呼吸专科医联体单位，山东省PCCM规范化建设优秀单位。临床工作中，除在呼吸内科常见病如慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、肺部感染、肺间质纤维化、自发性气胸等有专业特长外，在多种疑难杂症及急危重症诊治方面，例如难治性肺部感染、肺性脑病、急性呼吸窘迫综合征、肺癌的早期诊断、胸腔积液的病因诊断、耐多药结核病、难治性哮喘等疾病均有独到之处，有较高的抢救成功率及疑难罕见病的诊断正确率。
本科室具有独立的专科门诊、肺功能室、电子支气管镜室和呼吸综合诊疗室。配置了Olympus全套电子支气管镜检查及摄像系统2套、内科胸腔镜检查系统1套、氩气高频电刀1套、冷冻治疗仪1台，配备有无创呼吸机6台、CHESTAC-8900D肺功能仪1台、经鼻高流量湿化氧疗仪2台、FeNO检测仪1台、血气分析仪1台、震动排痰仪1台等多种医疗设备。能针对不同的呼吸衰竭或肺性脑病患者进行无创通气治疗、经鼻高流量湿化氧疗，能完成内镜下气道肿物消融、气道支架置入、良恶性气道狭窄扩张、冷冻治疗、氩气等离子治疗、肺灌洗、气道异物取出、内科胸腔镜检查、难治性气胸肺大泡消融等呼吸诊疗操作。伴随着超细内镜及超声内镜的引进，肺小结节及气管外病变诊治水平会有质的飞跃。